До 1804 г. Томск входил поочередно в состав Сибирской губернии, Енисейской провинции, Тобольской губернии.

В 1804 г. по указу императора Александра 1 от 26 февраля этого года за N 21183 в результате разделения Тобольской губернии была образована самостоятельная Томская губерния с центром в г.Томске в составе 8 округов: Томского, Каинского, Красноярского, Енисейского, Туруханского, Нарымского, Кузнецкого и Бийского. Округа, в свою очередь, делились на волости. За время существования губернии ее территориальный состав неоднократно менялся.

По состоянию на 1913 год площадь Томской губернии составляла 800 тыс. кв. км. население - 3,9 млн. жителей: русские, украинцы, белорусы, поляки, чуваши, татары и др., в северных районах селькупы, ханты. Разнообразие этнического состава населения объясняется тем, что Томская губерния длительный период была местом административной ссылки, а также добровольным переселением.

Во главе губернии стоял губернатор. Управление губернией осуществляла сеть административных, финансовых, полицейских и судебных учреждений (губернское правление, губернское жандармское управление, губернские казенная палата и казначейство, губернский, затем окружной, суд и др.).

Томск являлся административным центром созданной в 1834 году Томской епархии, включавшей Томскую и до 1862 года Енисейскую губернии, Западно-Сибирского учебного округа, Сибирской железной дороги и др.

Основные занятия жителей губернии: земледелие, скотоводство в южных округах(уездах), на севере - охота, рыболовство, кедровый промысел. Промышленность губернии была представлена ремесленными и другими небольшими по объему производства и количеству рабочих предприятиями: кожевенными, мыловаренными, водочными, кирпичными, крупчатыми мельницами и др.

Были развиты кустарные промыслы - обработка дерева, шерсти, кожи, глины и т.д.

В середине ХIХ века, в связи с открытием месторождений золота в Мариинской тайге и разработкой золотых приисков, Томск стал центром крупного золотопромышленного района.

В 1 половине ХIХ века Томск, занимая центральное место на Московском тракте, был крупным торговым центром.

С конца ХIХ века Томск становится крупным научно-просветительским центром Сибири: в 1888 году открыт первый в Сибири университет, в 1900 году технологический институт, в 1901 году -Сибирское коммерческое училище (первое этого типа учебное заведение в Сибири), в 1910 году - Сибирские высшие женские курсы. При университете были созданы медицинские клиники, а также единственный в Сибири бактериологический институт.

Помимо высших учебных заведений на территории губернии функционировали губернские гимназии, уездные училища, городские приходские училища, частные и церковноприходские школы. По данным 1892 года, их количество по губернии составляло 483, в том числе в Томске - 39, окружных городах - 25, округах - 419.

В 1919 году в Томской губернии была установлена Советская власть. В первые годы ее существования губернское деление сохранялось. Функции управления перешли губернскому, уездному и волостным Советам рабочих, крестьянских и солдатских депутатов.

Томская губерния, в числе прочих, была ликвидирована в 1925 году и образован Томский округ в составе Сибирского края (центр- г. Новосибирск).

В дальнейшем территория современной Томской области входила в состав: июль 1930 г. - сентябрь 1937 г. Западно-Сибирского края (центр - г. Новосибирск); сентябрь 1937 г. - август 1944 г. Новосибирской области.

По Указу Президиума Верховного Совета СССР от 13 августа 1944 года была образована Томская область с центром в г. Томске.

Территория вновь образованной области составляла 314,3 тыс. кв. км, население - около 600 тыс. человек (1944 г.). Подавляющая часть жителей русские, кроме них проживают украинцы, белорусы, немцы, татары и др., в северных районах - селькупы, ханты, эвенки.

В 20-30-е годы наиболее развитыми в сельскохозяйственном отношении были районы юго-восточной части области; в северных и западных районах преимущественно были развиты лесное хозяйство, рыбные и охотничьи промыслы.

Основная часть промышленных предприятий располагалась в г. Томске. В эти годы действовали весовой завод, швейная и макаронная фабрики, фабрика карандашной дощечки, молочный завод, завод "Металлист". Значительная часть предприятий промышленности специализировалась на переработке природных ресурсов области - трест "ТОМЛЕС" (одно из старейших и крупнейших лесозаготовительных предприятий Сибири), лесоперевалочные комбинаты, лесопильные заводы, рыбоконсервные заводы, заводы по добыче живицы, смолы, производству дегтя.

В послевоенный период на базе эвакуированных в Томск из европейской части страны промышленных предприятий в области начали развиваться машино- и приборостроение, металлообработка, инструментальное, подшипниковое производства, а с открытием в Томской области нефти и газа - нефтегазодобывающая отрасль.

Возросла роль областного города как научного и культурного центра: были открыты педагогический, медицинский и инженерно-строительный институты, институт автоматизированных систем управления, ряд научно-исследовательских институтов.